Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcqQ02111 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms