Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms