Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx3-1P97436 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms