Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim43bP86448 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim43bP86448 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms