Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx2P81066 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms