Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1bP70700 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms