Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx4P70452 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx4P70452 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx4P70452 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms