Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms