Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbdP63072 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UbdP63072 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UbdP63072 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UbdP63072 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UbdP63072 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UbdP63072 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms