Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uba52P62984 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uba52P62984 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uba52P62984 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms