Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCD1P59942 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCD1P59942 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms