Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdcd5P56812 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms