Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp1P55194 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms