Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp9P49962 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp9P49962 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms