Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cav1P49817 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms