Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox2P48432 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms