Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbx2P48031 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms