Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms