Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx1P43345 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms