Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mmp9P41245 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp9P41245 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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