Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col18a1P39061 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col18a1P39061 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col18a1P39061 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms