Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoc3P33622 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoc3P33622 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms