Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Saa4P31532 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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