Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc10P31257 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc10P31257 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms