Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BgnP28653 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BgnP28653 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BgnP28653 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BgnP28653 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BgnP28653 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BgnP28653 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BgnP28653 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BgnP28653 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BgnP28653 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BgnP28653 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms