Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb9P28076 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms