Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd8P23463 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd8P23463 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms