Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk1P22518 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms