Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prim1P20664 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prim1P20664 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms