Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc1P18828 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdc1P18828 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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