Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms