Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt8P11679 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt8P11679 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms