Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd4P10628 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms