Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UbbP0CG49 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbbP0CG49 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms