Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Saa2P05367 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Saa2P05367 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms