Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-K1P01901 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-K1P01901 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms