Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna1P01572 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna1P01572 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna1P01572 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna1P01572 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna1P01572 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna1P01572 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna1P01572 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna1P01572 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna1P01572 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna1P01572 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna1P01572 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna1P01572 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna1P01572 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna1P01572 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna1P01572 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms