Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl35aO55142 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rpl35aO55142 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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