Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atf6bO35451 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Atf6bO35451 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf6bO35451 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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