Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Dgcr6O35347 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dgcr6O35347 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms