Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms