Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra3O35118 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms