Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbsnO08976 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PbsnO08976 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms