Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltaO08585 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltaO08585 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltaO08585 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltaO08585 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltaO08585 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CltaO08585 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltaO08585 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltaO08585 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms