Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1oL7MU04 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms