Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm379J3QQ19 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Gm379J3QQ19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm379J3QQ19 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm379J3QQ19 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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