Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm21972J3QN38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm21972J3QN38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21972J3QN38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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