Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm21818J3KMS6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21818J3KMS6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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