Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34aG3UW52 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms