Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp72F8VQC1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms